二十年前的这项高等教育的改革试点，缩小了中国教育与国外先进教育理念的差距；与此同时也为中国学生创造一个“不出国的留学经历”，即让学生在国内就能在与美国同样的教育理念下得到思维和能力的培养。创办院长倪军认为，学生如果能在本科时期、在国内建立了对中国的文化、社会、工业现状等了解，未来海外学成归来后，能够在中国发挥更大的作用。他表示，“既然决定要做院长，就要把美国好的、先进的教育理念带进来，同时把国内教育体系中好的方面保留，做世界上最好的教育。”
如今，密院设有电子与计算机工程、机械工程和材料科学与工程等三个本科专业，以及七个研究生专业。其中本科设有4+0（交大本科学位项目）和2+2（交大-密歇根本科双学位项目）模式，选择前者的学生在上海交通大学完成四年的学习，毕业后取得上海交通大学的毕业证书，学士学位证书和密西根学院的学习证书；选择后者的学生则在上海交通大学完成前两年的学习，并赴密歇根大学完成后两年学习，学生在满足两校的毕业要求后将分别获得上海交通大学的毕业证书以及上海交通大学和密歇根大学两个不同专业的本科学士学位。
然而，这一切于昨天戛然而止！
当地时间2025年1月10日，密歇根大学正式宣布终止与上海交通大学的长期合作，结束了这一持续近20年的联合办学关系。
该公告是在美国众议院相关特别委员会主席约翰·穆勒纳尔致信密歇根大学校长小野桑塔后发布的。在致国会议员的信件中，小野校长表示经过彻底的审查，该校启动为期六个月的流程，“正式终止与上海交通大学的合作关系”。小野称该校在重视国际学术合作伙伴关系的同时，也“非常注重国家安全问题”，并将更好地审查国际学生的签证要求。
在密歇根大学终止合作新闻稿中，校方称，成立于2005年的交大密院办学质量傲视众多国际教育机构，该院提供的工程学位项目获得美国工程技术认证委员会认证，其所有课程均以英语授课，几乎所有学生均远赴海外寻求国际教育体验。二十年来，双方合作关系促成众多学术交流，包括双学位项目、奖学金和出国留学机会。交大密院共计为来自密歇根大学和其他高校的上千名本科生提供全球就读体验。
密歇根大学负责交大密院的管理者强调，目前密大在读学生可以不受合作终止的干扰而顺利完成学业。这意味着已在密歇根大学就读大三或大四的学生可以继续按计划完成学业，而目前在上海交大就读大一或大二的学生无法赴美完成2+2项目。
终止合作的起因或源于去年10月的一起事件，当时5名在美国密西根大学学习的中国公民（均来自交大密院）被指控在格雷林营地对密西根国民警卫队营地进行所谓的“间谍活动”。
作为密西根大学与中国高校合作项目的参与者，这些学生的行为引发众多质疑。
密西根州州长格雷琴·惠特默面临的压力巨大，她不仅需要就格雷林营地的安全问题向公众作出交代，还需考虑如何平衡国家安全与促进经济发展的关系，而处理密西根大学与上海交通大学的合作关系，也成为摆在她面前的棘手问题。
美国国会众议院相关特别委员会主席、密歇根州共和党籍联邦众议员约翰·穆勒纳尔致信小野校长，要求他关闭交大密院项目，“我们国家的所有大学都必须关闭与中国高校的联合机构，并对新兴技术研究制定更严格的保护措施。美国大学必须意识到他们是非法活动的目标，并保护其由纳税人资助的关键研究。”
小野校长于周五向穆勒纳尔通报了校方终止合作关系的决定。
此前的2020 年，密歇根大学两名中国硕士生因非法拍摄佛罗里达州基韦斯特海军航空站而被判入狱。
去年10月，密歇根大学一名中国学生被控在大选期间非法投票，这是一起罕见的非美国公民投票案例。
穆勒纳尔还写道，中国大学拥有“大量与军方相关的院系和实验室、先进的两用研究项目和大型作战训练平台”，有助于推动中国军事现代化和情报能力。
随着该委员会提出国家安全风险担忧，密歇根大学成为过去五个月第三所终止与中国高等院校合作办学的美国大学。去年秋天，佐治亚理工学院宣布终止佐治亚理工学院深圳联合学院，加州大学伯克利分校则结束与清华大学的合作伙伴关系。
去年九月发布的一份报告中，该委员会列举了21所与中国大学在理工科领域合作办学的美国大学，并特别指出其对于国防部资助研究项目（包括高性能炸药、无人机操作网络、核子和高能物理、人工智能、量子技术和超高音速）表示担忧。
